歷經八年跨領域合作，國立清華大學生命科學暨醫學院分子與細胞生物研究所暨學士後醫學系王慧菁老師率領研究團隊成功開發全球首創可克服三陰性乳癌多重抗藥性的 KIF2C 小分子抑制劑「7S9」。研究成果登上國際頂尖期刊《Developmental Cell》封面，不僅為三陰性乳癌治療帶來新的突破，也展現清華大學在基礎研究、新藥開發與跨領域合作上的深厚實力。
走進位於生科一館六樓的王慧菁老師實驗室，映入眼簾的是學生親手製作的病毒模型、牆上的師生簽名，以及一處供團隊交流的小型休息空間。相較於一般人印象中嚴肅的研究環境，這裡多了一份溫暖與活力，也反映出團隊鼓勵合作、重視交流的研究文化。正是在這樣的氛圍中，一項歷時八年的跨領域研究逐步成形，最終突破三陰性乳癌抗藥性的重要瓶頸。
三陰性乳癌因缺乏 ER、PR 與 HER2 三種受體，目前仍缺少有效的標靶治療，臨床主要依賴化療藥物。然而，高復發率與多重抗藥性一直是治療上的重大挑戰。
研究契機來自跨領域合作。王慧菁老師鼓勵學生運用系統生物學與大數據分析癌症基因表現，發現 KIF2C 蛋白異常高表現，並證實其為造成化療抗藥性的關鍵蛋白，也因與老師博士後研究經驗相互呼應，得以快速展開深入研究。
研究初期，「運用系統生物學與大數據尋找新藥」的跨領域概念尚未受到普遍重視，團隊一度面臨研究經費不足的挑戰。直到獲得清華大學「競爭型潛力研究團隊加火種計畫」支持後，研究得以順利推進，也成為整合跨機構研究能量的重要契機。王慧菁老師隨即組建跨領域研究團隊，由清華大學孫玉珠老師協助解析 KIF2C 與微管的蛋白質結構，並與國家衛生研究院謝興邦所長、林書玉博士共同投入小分子藥物設計與化合物合成，郭靜娟博士則協助規劃動物試驗。透過跨校、跨機構合作，團隊逐步完成蛋白質結構解析、藥物設計、化合物合成及動物試驗等關鍵研究工作，為後續新藥開發奠定重要基礎。
經多年篩選與優化，團隊成功開發全球首創 KIF2C 小分子抑制劑「7S9」。研究證實，7S9 能恢復抗藥性癌細胞對紫杉醇的敏感性，並與其他微管藥物產生良好協同效果，具備發展為廣效化療增敏劑的潛力。
王慧菁老師指出，AI 已大幅提升蛋白質結構分析、藥物篩選及藥物設計效率，但真正的新藥研發仍需仰賴化學合成、細胞與動物實驗，以及毒理與安全性驗證，因此未來更需要兼具 AI 應用與實驗能力的跨領域人才。
在教學方面，她透過病毒模型製作、手寫測驗及多元評量，引導學生培養科學思辨與解決問題能力。
王慧菁老師重視團隊合作與創新文化，鼓勵學生交流想法，建立支持彼此的研究環境。此次論文第一作者包原韶在老師支持下成立「醫莉鎂生醫（Beliminate Biotech）」，持續推動研究成果朝向臨床應用與產業發展。
除了乳癌研究外，團隊亦積極投入 B 型肝炎病毒研究，希望透過奈米抗體技術與 cccDNA 研究，發展更有效的治療策略。
王慧菁老師勉勵學生以「以終為始」規劃人生，培養跨領域能力與持續學習精神。從三陰性乳癌新藥開發、B 型肝炎研究，到 AI 時代的人才培育，她持續以創新研究回應重大醫療需求，展現清華大學生醫研究的國際競爭力。
論文連結：https://doi.org/10.1016/j.devcel.2025.03.004
採訪．撰文／醫學科學系黃宏偉